• 神经外科 ：在颅脑外伤、癫痫外科等多个领域处于国内先进水平。
• 呼吸与危重症医学科 ：对疑难病如弥漫性间质性肺疾病、肺囊性纤维化等的诊治水平居中国西部前茅。
• 泌尿外科 ：拥有目前国内床位数最多的泌尿外科病房，整体学术水平长期位居全国前列。
• 重症医学科 ：国内规模最大、亚专业最齐全的重症医学临床和教学基地，年收治重症患者万余人，治愈成功率95%以上。
• 康复医学科 ：全国床位数最多的康复医学科之一，引进了欧美现代康复技术与模式。
• 风湿免疫科 、 骨科 、 精神医学科 、 麻醉科 、 内分泌科 、 皮肤科 、 普通外科 、 神经内科 、 消化病科 、 心血管病科 、 心外科 、 胸外科 、 肿瘤科 、 老年医学科 、 核医学科 、 超声医学科 、 急诊医学科 、 健康管理科 、 结核病科 、 全科医学科 、 检验医学科 、 传染感染科 、 放射科 、 病理科 等也都是重点学科。

• 成人活体肝脏移植
• 肺癌外科和微创治疗
• 心脏介入治疗
• 脑神经外科及功能神经外科
• 中西医结合治疗重症胰腺炎
• 胃肠微创手术
• 临床麻醉
• 功能磁共振
• 核医学

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